生物安全柜内无微生物的环境中不需要明火。在敞开的长凳上，燃烧培养皿的颈部将产生向上的气流，防止微生物落入管或烧瓶中。然而，生物安全柜内的明火造成湍流，扰乱了供给工作表面的空气模式。当被视为**必要时可以使用配备有指示灯以根据需要提供火焰的触板微燃烧器。内部机柜空气干扰和热量累积将被**小化。工作完成后，燃烧器必须关闭。在柜内使用明火时，其附近任何酒精或易燃液体都可能引起火灾，因此必须小心谨慎。小型电炉可用于净化细菌环和针头，优于BSC内的明火。使用预处理的无菌环也是一个不错的选择。
在斯坦福大学明火备忘录 证明了大学的努力，禁止明火在生物安全柜。
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